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蘇曉泉教授課題組用大數(shù)據(jù)引擎繪制全球微生物組轉(zhuǎn)化網(wǎng)絡(luò)

作者:    來源:計算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院      編輯:郭書君   日期:2021年07月15日 23:33   閱讀:1

新聞網(wǎng)訊 在自然界的各種生態(tài)系統(tǒng)中,微生物以群落(即“微生物組”)的形式廣泛存在并相互作用,從而深刻地塑造著地球生物圈的功能。然而,微生物組多樣性的形成和演變過程一直懸而未決。近日,我校計算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院蘇曉泉教授課題組提出了一種基于大數(shù)據(jù)搜索的理論模型,從多個尺度探索不同生態(tài)系統(tǒng)之間微生物組的內(nèi)在關(guān)聯(lián)與演化規(guī)律。該研究于7月13日發(fā)表于mSystems(美國微生物學(xué)會會刊,SCI IF=6.50)。

基于該理論模型,研究人員運用前期開發(fā)的微生物組搜索引擎(MSE; http://mse.ac.cn)和超過17萬例樣本,計算和繪制了首個全球性的“微生物組相互轉(zhuǎn)化網(wǎng)絡(luò)”,從而刻畫出不同生態(tài)系統(tǒng)中微生物組最可能的演化途徑,對于重構(gòu)歷史上曾經(jīng)存在過的微生物組,或設(shè)計全新的微生物組,具有重要的指導(dǎo)意義。該研究是與中科院青島能源所及加州大學(xué)圣地亞哥分校等機(jī)構(gòu)合作完成,并得到了國家自然科學(xué)基金、中國科學(xué)院微生物組計劃等項目的支持。

論文鏈接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.00394-21


    

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